Книжный фонд Музея создается с 1987 года. Он насчитывает в настоящее время более 2 тыс. единиц хранения и состоит из двух больших подразделений: фонда редкой книги и научной библиотеки. Первый фонд, являющийся основным хранением, состоит из следующих разделов:

• мемориальные библиотеки кинематографистов Сергея Эйзенштейна, Андрея Тарковского, Германа и Изабеллы Эпштейн, Юрия Катина- Ярцева, Андрея Москвина, Николая Лебедева, Александра Андриевского, Григория Александрова, Георгия Мясникова и других. Среди этих изданий немало книг с ценными автографами — Сергея Эйзенштейна, Льва Кулешова, Вениамина Вишневского, Сергея Юткевича, Григория Александрова, Григория Козинцева, Николая Акимова, Михаила Рома и других известных деятелей кино.

Тематическое богатство историко-киноведческой части собрания позволило дифференцировать его следующим образом:

• книги по истории и теории кино (среди его раритетов: Кинематограф. Живая фотография, 1909, Е. Маурин. Кинематограф в практической жизни; Практическое руководство под редакцией М. Н. Алейникова),
• кинотехника (В. С. Нильсен. Техника комбинированной киносъемки, 1933, из библиотеки автора, или Л. Лабель. Техника кинематографии, 1926, примеры редких ныне книг),
• справочная литература,
• киносценарии,
• кинопериодика (мы располагаем такими ценными изданиями, как «Кинематограф для России», Берлин, 1921,1922; «Кадр», Ленинград, 1932, 1933; Вестник кинематографии», 1914; «Проэктор», 1915—1916 гг. и др.). Ценность этого фонда в том, что история развития кинематографа представлена в работах 1910–1940-х годов, то есть осмысленна по следам текущих событий, не имеет временного цензора. Книги, издававшиеся малыми тиражами (например, ранняя литература по кинотехнике), русская и зарубежная кинопериодика.

Научно-вспомогательный фонд, состоит из русских и иностранных книг по истории и теории кино, богатого собрания персоналий кинематографистов, фильмографических справочников по кино всего мира, современной кинопериодики. Научной библиотекой Музея пользуются кинематографисты многих стран мира. В комплектовании фонда Музея участвовали Госфильмофонд РФ, обменный фонд Российской государственной библиотеки, частные лица — Е. А. Скиба, Г. Л. Демосфенова, Н. А. Кипиани, К. Н. Лебедева, Е. Е. Андриакис, А. Сафонов и другие.